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上海代生的具体流程,鱼类异型染色体融合起源研究获进展

 2022-04-16 14:20  


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,Cell子刊iScience在线刊发中国科学院大陆研究所李军研究组与刘静研究组协作实现的题为Chromosome-levelGenomeRevealstheOriginofNeo-YChromosomeintheMaleBarredknifejawOplegnathusfasciatus的研讨论文。该研讨初次从全基因组层面证明条石鲷雄鱼存在染色体融会景象,办理了雄鱼异型染色体Y融会起源问题,为鱼类异型染色融会演化及性别决意机制解析奠基了紧张根底。

条石鲷隶属于石鲷科,该科包括7个种,此中条石鲷跟斑石鲷次要漫衍正在西太平洋海疆,别的5种次要漫衍正在印度洋海疆。李军研究组2008年率先构建了条石鲷跟斑石鲷苗种齐人工繁育技巧工艺,实现了条石鲷跟斑石鲷苗种的规模化繁育,耦合的“陆海接力”养殖新形式,实现了条石鲷跟斑石鲷的高效养殖,并取得2015年大陆科学技术奖二等奖。现阶段,条石鲷跟斑石鲷,200元/千克,养殖范围正逐年扩展。

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研讨职员经由过程后期染色体核型及带型剖析发明条石鲷跟斑石鲷染色体体系存在一个配合特色:雄鱼(2n=47)染色体较雌鱼(2n=48)少一条,而且雄鱼染色体中存在一条体型异常极大的染色体,料到它们的性别决意类型能够为X1X1X2X2/X1X2Y。据已报导的文献资料显现,世界上存在复性性染色体体系的硬骨鱼类有60余种,此中存在X1X1X2X2/X1X2Y体系的硬骨鱼类有37种,绝大多数为存在养殖跟渔业增殖代价的鱼种。复性性染色体体系中异型染色体的起源及遗传构成形式,是一个紧张的演化生物学问题。

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该研讨综合采取二代Illumina测序、三代PacBio测序跟染色体构象捕捉Hi-C技巧,正在国际上率先实现了条石鲷雌、雄染色体程度基因组组装、正文、牝牡基因组比力事情,取得了条石鲷雌、雄个别染色体程度的高质量基因组;绘制了雄鱼异型染色体Y的基因组序列跟功用基因构成图谱,正确展现异型染色体Y基因组巨细为94.2Mb,包括3064个基因,此中Y染色体特有基因172个,波及着丝粒组装卵白P(cenpp)、联会复合体组装卵白(sycp1)、染色体传送保真度卵白8(ctf8)等染色体组装跟有丝/减数分裂相关基因,特有基因为实现雄鱼二态型精子(精子1型:22+X8+X10=24;精子II型:22+Y9=23)染色体的组装及不变遗传供给了保证。基于染色体序列及功用基因同线性模块剖析,初次提出雄鱼异型染色体Y起源于8号跟10号染色体端着丝粒的断裂融会,异型染色体Y存在显著的染色体布局变异(SV)。基于齐基因组信息解析条石鲷异型染色体融会起源是硬骨鱼X1X1X2X2/X1X2Y体系研讨的首例,为后续硬骨鱼X1X2Y体系的造成形式及演化能源研讨供给了参考,造、抗病选育研讨奠基了根底。条石鲷雌鱼研讨成果颁发正在生物范畴综合性刊物GigaScience,牝牡基因组比力及异型染色体Y融会起源研讨颁发正在iScience。

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中科院大陆年夜科学研究中间为文章第一实现单元,副研究员肖永双跟研究员肖志忠为文章配合第一作者,研究员李军跟刘静为文章配合通信作者。该研讨失掉国度重点研发筹划、国家自然科学基金委、山东省重点研发筹划、助。

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